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Approches « omiques » en cosmétique par Gilbert Skorski – PHYLOGENE aux JED

Voici un extrait de la conférence de Gilbert Skorski présentée aux JED le 31 janvier 2017

Lien vers le pdf: Phylogene-Multi-omique G.Skorski.Extrait.JED.310117

L’idée de base associée aux approches « omiques » consiste à appréhender la complexité du vivant dans son ensemble, au moyen de méthodologies les moins restrictives possibles sur le plan descriptif. Ces approches peuvent en particulier être utiles pour mettre en évidence et identifier de nouveaux biomarqueurs (d’exposition, d’effet ou de susceptibilité), générer de nouvelles connaissances sur le plan mécanistique (modes d’action), ou encore élaborer de nouveaux outils de toxicologie prédictive pour aider à l’identification des dangers.
Caractérisées comme des techniques à haut débit permettant une analyse simultanée d’un grand nombre de variables, elles comprennent principalement:

la génomique (SNPs par exemple),
la transcriptomique (expression des gènes et leur régulation),
la protéomique (analyse des protéines),
la métabolomique (étude des métabolites produits).

Ces approches permettent d’obtenir de très nombreuses informations sur la réponse cellulaire et/ou tissulaire à une exposition in vitro ou in vivo.

Contexte des différentes omiques

-Sont de différents niveaux d’information (identification vs quantification, Cinétiques différentes, Echantillonnage )
-Sont de différents niveaux de fiabilité,
-Sont plus ou moins éloignées de la biologie finale
-Cumulent les coûts

Les approches multi-omiques permettent de renforcer la solidité des analyses en augmentant leur spécificité

Challenges

– Mettre en correspondance les données hétérogènes des différentes
méthodes et prendre en compte les corrélations entre elles
– Modéliser une représentation complète des multiples omiques avec
une approche des réseaux qui illustre naturellement les relations entre
différentes entités dans une cellule.
– Gérer le problème de l’analyse des données de taille énorme.

Une approche pragmatique multi-omique en cosmétique consiste à se placer au plus près du phénotype en utilisant des données homogènes de transcriptomique et protéomique.